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यह अध्ययन प्रकट करता है कि कैंसर कोशिकाएं ड्रग-प्रेरित डीएनए क्षति को रोकने के लिए टोपोइज़ोमेरेज़ II क्लीवेज साइट्स पर आवर्तक उत्परिवर्तन (recurrent mutations) संचित करके डॉक्सोरूबिसिन के प्रति प्रतिरोध विकसित करती हैं, एक ऐसी प्रक्रिया जो अनुकूलित कोशिकाओं को टोपोइज़ोमेरेज़ I इनहिबिटर्स के प्रति संवेदनशील भी बना देती है।
अल्ट्रा-डीप डुप्लेक्स सीक्वेंसिंग का उपयोग करते हुए, यह अध्ययन प्रकट करता है कि ली-फ्रौमेनी सिंड्रोम में जर्मलाइन TP53 p.R181H वेरिएंट सामान्य ऊतकों में बेसलाइन दैहिक उत्परिवर्तन पैटर्न और चयन गतिशीलता को पुनर्गठित करता है, जो बढ़े हुए उत्परिवर्तनशीलता, दैहिक TP53 उत्परिवर्तनों के लिए कम सकारात्मक चयन, और वाइल्ड-टाइप गुणसूत्र प्रति (copy) पर होने वाले उत्परिवर्तनों के प्रति एक विशिष्ट प्राथमिकता द्वारा अभिलक्षित है।
यह शोध पत्र cfClone को प्रस्तुत करता है, जो एक बेयसियन (Bayesian) ढांचा है जो बल्क टिश्यू संदर्भों पर निर्भर हुए बिना, क्लोनल इवोल्यूशन और चिकित्सीय प्रतिरोध की उच्च-रिज़ॉल्यूशन, ऊतक-सूचित (tissue-informed) और अनिश्चितता-जागरूक ट्रैकिंग को सक्षम करने के लिए सिंगल-सेल होल-जीनोम सीक्वेंसिंग को सर्कुलेटिंग ट्यूमर डीएनए डेटा के साथ एकीकृत करता है।
यह अध्ययन 809 ट्यूमर और 523 सामान्य नमूनों का विश्लेषण करके एक प्रयोग-आधारित प्रचुरता कवरेज सीमा (abundance coverage frontier) स्थापित करता है जो TP53-मिसेंस ट्यूमर के लिए सशर्त RHSVV एक्सपोजर आवश्यकताओं को परिभाषित करता है, साथ ही एक व्यावहारिक R≥3 प्रचुरता सीमा की पहचान करता है, जबकि स्पष्ट रूप से यह उल्लेख करता है कि वास्तविक चिकित्सीय प्रभावकारिता और सुरक्षा अभी भी अपरिभाषित है।
यह अध्ययन मस्तिष्क, यकृत और फेफड़ों से प्राप्त मानव मेलानोमा मेटास्टेसिस पर सिंगल-न्यूक्लियस आरएनए सीक्वेंसिंग का उपयोग करता है ताकि एक मल्टी-ऑर्गन एटलस का निर्माण किया जा सके, जो विशिष्ट घातक विभेदन अवस्थाओं (malignant differentiation states) और अंग-विशिष्ट प्रतिरक्षा एवं स्ट्रोमल अनुकूलनों को प्रकट करता है जो दूरस्थ स्थलों में ट्यूमर माइक्रोएन्वायरमेंट की विषमता को परिभाषित करते हैं।
यह अध्ययन प्रकट करता है कि यूरोथेलियल कैंसर कोशिकाएं मास्टर ट्रांसक्रिप्शन फैक्टर्स को व्यक्त करने के बावजूद टर्मिनल डिफरेंशिएशन (अंतिम विभेदन) से बच जाती हैं क्योंकि जीनोमिक परिवर्तन ट्रांसक्रिप्शनल हब के भीतर क्रोमैटिन-ओपनिंग को-एक्टिवेटर्स और क्रोमैटिन-क्लोजिंग कोरिप्रेशर्स के बीच के संतुलन को बाधित करते हैं, एक ऐसा अवरोध जिसे को-एक्टिवेटर्स को बहाल करके या कोरिप्रेशर्स को बाधित करके डिफरेंशिएशन प्रोग्राम को पुन: सक्रिय करने के लिए उलटा जा सकता है।
यह अध्ययन प्रदर्शित करता है कि मानव मस्तिष्क ऑर्गेनॉइड्स (brain organoids) में ग्लियोब्लास्टोमा आक्रमण, विशेष रूप से SLC12A5/KCC2 अभिव्यक्ति और क्लोराइड होमियोस्टेसिस के नुकसान के माध्यम से, GABAergic न्यूरॉन्स में गहरा और निरंतर व्यवधान उत्पन्न करता है, जो टेमोज़ोलोमाइड कीमोथेरेपी के बाद भी अपरिवर्तित रहता है।
यह अध्ययन बाल चिकित्सा मेटास्टैटिक ऑस्टियोसारकोमा के एकीकृत मल्टी-ओमिक विश्लेषण का उपयोग करता है ताकि महत्वपूर्ण कोशिकीय प्लास्टिसिटी (cellular plasticity) को प्रकट किया जा सके, जो यह प्रदर्शित करता है कि एंडोथेलियल कोशिकाएं ऑस्टियोब्लास्ट जैसी विशेषताओं को अपनाती हैं और ट्यूमर कोशिकाएं संवहनी अनुकरण (vascular mimicry) प्रदर्शित करती हैं, जिससे इस बीमारी की जीव विज्ञान और सूक्ष्म वातावरण के वर्तमान मॉडलों को चुनौती मिलती है।
यह अध्ययन कीमोरेसिस्टेंस (chemoresistance) के विकास को मैप करने और कोलेटरल ड्रग सेंसिटिविटी (collateral drug sensitivity) के विशिष्ट पैटर्न की पहचान करने के लिए एक क्लिनिकली कैलिब्रेटेड, टेम्पोरली रिजॉल्व्ड इन विट्रो ऑस्टियोसारकोमा मॉडल का उपयोग करता है, जबकि साथ ही रिलेप्स्ड या रिफ्रैक्टरी रोगियों के लिए व्यक्तिगत सेकंड-लाइन उपचार रणनीतियों को निर्देशित करने हेतु प्रेडिक्टिव ट्रांसक्रिप्टोमिक सिग्नेचर निकालता है।
यह अध्ययन सिग्लेक-15 (Siglec-15) को प्रोस्टेट कैंसर में एक महत्वपूर्ण ग्लाइको-इम्यून चेकपॉइंट के रूप में पहचानता है जो इम्युनोसप्रेसिव मैक्रोफेज और ऑस्टियोक्लास्ट विभेदन को बढ़ावा देकर इम्यून इवेजन और बोन मेटास्टेसिस को संचालित करता है, जबकि यह प्रदर्शित करता है कि सिग्लेक-15 का चिकित्सीय अवरोध प्रीक्लिनिकल मॉडलों में CD8+ टी-सेल प्रतिक्रियाओं को बहाल करता है और ट्यूमर की वृद्धि को रोकता है।